Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox19Q62249 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox19Q62249 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox19Q62249 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sox19Q62249 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms