Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PtprrQ62132 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprrQ62132 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms