Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms