Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms