Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd55bQ61476 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms