Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd53Q61451 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms