Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BcanQ61361 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BcanQ61361 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BcanQ61361 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BcanQ61361 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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BcanQ61361 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BcanQ61361 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BcanQ61361 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BcanQ61361 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BcanQ61361 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BcanQ61361 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms