Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms