Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp4Q61107 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4Q61107 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms