Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms