Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift20Q61025 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms