Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf8Q60846 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms