Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf3Q60803 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms