Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P4ha2Q60716 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P4ha2Q60716 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms