Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Akap4Q60662 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Akap4Q60662 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms