Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CttnQ60598 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms