Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ncoa4Q5U4H9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms