Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms