Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam71bQ5STT6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam71bQ5STT6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms