Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap44Q5SSM3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap44Q5SSM3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms