Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms