Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms