Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav8d-2Q5R1B6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav8d-2Q5R1B6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav8d-2Q5R1B6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav8d-2Q5R1B6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trav8d-2Q5R1B6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trav8d-2Q5R1B6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms