Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms