Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam20cQ5MJS3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam20cQ5MJS3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms