Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AY761185Q5ERI8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms