Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBE8

Wdr18, WD repeat-containing protein 18, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr18Q4VBE8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Wdr18Q4VBE8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Wdr18Q4VBE8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Wdr18Q4VBE8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr18Q4VBE8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms