Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms