Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Fam220aQ3ZN08 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Fam220aQ3ZN08 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam220aQ3ZN08 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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