Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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Lrrc43Q3V0L5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc43Q3V0L5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Lrrc43Q3V0L5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Lrrc43Q3V0L5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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