Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr7Q3V0I2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr7Q3V0I2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms