Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc27Q3V036 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc27Q3V036 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms