Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3UZV7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3UZV7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms