Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm12888Q3UW77 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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