Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Znf48Q3US17 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Znf48Q3US17 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Znf48Q3US17 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Znf48Q3US17 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Znf48Q3US17 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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