Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbm20Q3UQS8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rbm20Q3UQS8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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