Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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D13Ertd608eQ3UPR8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms