Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms