Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnep1r1Q3UJ81 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms