Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm648Q3UJ22 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms