Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmod2Q3UHZ5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmod2Q3UHZ5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmod2Q3UHZ5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod2Q3UHZ5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod2Q3UHZ5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod2Q3UHZ5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod2Q3UHZ5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmod2Q3UHZ5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmod2Q3UHZ5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmod2Q3UHZ5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms