Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mier3Q3UHF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mier3Q3UHF3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms