Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnrc6cQ3UHC0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms