Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5113Q3UGK8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5113Q3UGK8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms