Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rrp36Q3UFY0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms