Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trip13Q3UA06 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms