Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cops9Q3U898 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms