Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ulk3Q3U3Q1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms