Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fubp3Q3TIX6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fubp3Q3TIX6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fubp3Q3TIX6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms