Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms